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| 品(pin)牌(pai) | NobleRyder/諾(nuo)博(bo)萊(lai)德(de) | 貨號 | 42119 |
|---|---|---|---|
| 規格(ge) | 20次(ci)/60次(ci) | 供貨(huo)周期 | 現(xian)貨(huo) |
| 主(zhu)要用途(tu) | Simple載(zai)體(ti)快(kuai)速(su)克隆(long)試劑盒(he) T4原(yuan)理載(zai)體(ti) | 應用領(ling)域 | 環(huan)保,化工,生(sheng)物產(chan)業(ye),農(nong)林牧(mu)漁(yu),制(zhi)藥(yao)/生(sheng)物制(zhi)藥(yao) |
諾(nuo)博(bo)萊(lai)德(de) Simple載(zai)體(ti)快(kuai)速(su)克隆(long)試劑盒(he) T4原(yuan)理載(zai)體(ti)
pBLUE-T Simple載(zai)體(ti)快(kuai)速(su)克隆(long)試劑盒(he)
目(mu)錄號:42119
試劑盒(he)組(zu)成(cheng)、儲存、穩(wen)定性(xing):
試劑盒(he)組(zu)成(cheng) | 20次(ci) (42119-20) | 60次(ci) (42119-60) |
pBLUE-T Simple Vector(30ng/ml) | 20ml | 60ml |
1000bp Control(30ng/ml) | 5ml | 5ml |
10 ´ PEG Enhancer | 50ml | 150ml |
10 x Ligation Buffer | 40ml | 120ml |
2 ´Quick Ligation Buffer | 100ml | 300ml |
T4 DNA ligase, 5U/ml | 20ml | 60ml |
-20℃儲(chu)存,6個(ge)月(yue)內不(bu)影響(xiang)使(shi)用效(xiao)果(guo)。
具體(ti)產(chan)品(pin)的(de)參數(shu)以(yi)收(shou)到產(chan)品(pin)說(shuo)明書(shu)的(de)參數(shu)為準
產(chan)品(pin)介(jie)紹:
pBLUE-T Simple Vector是(shi)壹(yi)種(zhong)高效(xiao)克(ke)隆(long)PCR產(chan)物 (TA Cloning) 的(de)專用載(zai)體(ti)。這(zhe)種(zhong)載(zai)體(ti)是(shi)由(you)pBlueScript II SK(+)質(zhi)粒改(gai)建而(er)成(cheng),和(he)傳(chuan)統T載(zai)體(ti)ECOR V切(qie)開(kai)後加(jia)T方(fang)法(fa)不(bu)同,pSURE-T Simple 通過(guo)改(gai)造pBlueScript II SK(+),在(zai)原pBlueScript II SK(+)多(duo)克隆位(wei)點引入 Xcm I酶(mei)切(qie)後使(shi)其原多(duo)克隆位(wei)點兩(liang)側的3’末端(duan)直接產(chan)生(sheng)未配(pei)對(dui)的T堿(jian)基,因(yin)此(ci)有更(geng)高的重組效(xiao)率。同時(shi)它(ta)消除了(le)pBlueScript II SK(+)載(zai)體(ti)上的(de)多(duo)克隆酶(mei)切(qie)位(wei)點,需要在PCR擴增引物上導入合適的酶(mei)切(qie)位(wei)點。此(ci)時(shi)如果使(shi)用PCR擴(kuo)增引物導入的酶(mei)切(qie)位(wei)點進(jin)行DNA酶(mei)切(qie)時(shi),酶(mei)切(qie)反(fan)應將(jiang)不會(hui)受到T載(zai)體(ti)上其它(ta)多(duo)克隆酶(mei)切(qie)位(wei)點上的(de)限(xian)制(zhi)酶(mei)影響(xiang),可(ke)以(yi)大大提(ti)高酶(mei)切(qie)效(xiao)率,增(zeng)加(jia)亞(ya)克(ke)隆(long)成(cheng)功率。此(ci)外,本(ben)公司(si)載(zai)體(ti)連(lian)接體(ti)系(xi)還(hai)有(you)背(bei)景低(藍(lan)斑小於10%),重組率高(白(bai)斑中(zhong)超(chao)過90%有(you)插(cha)入片(pian)段(duan)),可(ke)快速(su)連接等(deng)特(te)點。本說(shuo)明書(shu)末列出(chu)了(le)pBLUE-T Simple 載(zai)體(ti)相(xiang)關的技術資(zi)料(liao),其全序列(lie)可(ke)參照(zhao)pBlueScript II SK(+)序列(lie),只(zhi)是其多(duo)克隆酶(mei)切(qie)位(wei)點處(chu)序列(lie)稍(shao)有(you)不同。
測(ce)序推(tui)薦(jian)采用M13通(tong)用測(ce)序引物和(he)T3啟動子(zi)引物(見後面圖譜(pu))
操作步(bu)驟:
1.連接反應的(de)準備(bei)
PCR產(chan)物是(shi)否要進(jin)行純(chun)化取(qu)決於擴增產(chan)物的(de)質量。如果PCR產(chan)物非常幹凈(jing),不經純(chun)化就(jiu)可(ke)直接進(jin)行連接反應。但(dan)如果是以(yi)質粒為(wei)模板(ban)的(de)PCR產(chan)物則必(bi)須進(jin)行純(chun)化,模板(ban)質(zhi)粒有(you)可(ke)能也形成(cheng)白(bai)斑。PCR產(chan)物可(ke)以(yi)通過(guo)瓊(qiong)脂糖凝膠(jiao)電泳(yong)分(fen)離(li)。本(ben)公(gong)司(si)生(sheng)產(chan)的DNA產(chan)物快(kuai)速(su)純(chun)化回收(shou)試劑盒(he)對(dui)70bp以(yi)上的(de)DNA片(pian)段(duan)能很(hen)好(hao)地進(jin)行回收(shou)。
Taq、Tth、AmpliTaq、KlenTaq DNA聚(ju)合酶(mei)擴增(zeng)的(de)PCR產(chan)物,其末端(duan)都帶(dai)有(you)壹個(ge)突出(chu)的3’ -A。 具有(you)3’ -A末端(duan)的PCR產(chan)物可(ke)以(yi)直接用pBLUE-T Simple 載(zai)體(ti)進(jin)行克隆(long)連(lian)接。具有(you)3’®5’外(wai)切(qie)酶(mei)活性(xing)的(de)DNA聚(ju)合酶(mei)(高保真酶(mei))擴增(zeng)的(de)PCR產(chan)物是(shi)平(ping)末端(duan),要對(dui)這種(zhong)平(ping)末端(duan)PCR產(chan)物進(jin)行克隆(long),應優(you)良行(xing)3’-端(duan)加(jia)A工作。
2. 常規連(lian)接反應:
1) 在(zai)壹(yi)個(ge)標(biao)準的(de)10 ml連(lian)接反應體(ti)系(xi)中(zhong),加(jia)入1 ml 30ng pBLUE-T Simple載(zai)體(ti)、X ml PCR產(chan)物(在(zai)通常狀況(kuang)下,沒有(you)必(bi)要對(dui)PCR產(chan)物進(jin)行精確定量,壹般(ban)PCR產(chan)物與載(zai)體(ti)的(de)摩(mo)爾(er)比優(you)化至2:1~10:1就(jiu)可(ke)以(yi)得到良好(hao)結果(guo),推(tui)薦(jian)3:1)、1ml 10´ligation Buffer和(he)0.5-1ml (2.5 -5 Weiss Units)的(de)T4 DNA Ligase,其余用水(shui)補足(zu)。反(fan)應按(an)以(yi)下體(ti)系(xi)進(jin)行:
1ml | 10´Ligation Buffer (用前(qian)充(chong)分(fen)融(rong)解(jie)混(hun)勻(yun)) |
1ml | 10´ PEG Enhancer |
1ml | pBLUE-T Simple Vector |
Xml | 純(chun)化後的(de)PCR產(chan)物/或(huo)者1ml 1000bp control |
Yml | 無(wu)菌水(shui) |
0.5-1ml (5 Weiss Units/ml) | T4 DNA Ligase |
Final Volume | 10ml |
壹(yi)般(ban)最後加(jia)入T4 DNA Ligase。
2) 16℃連(lian)接過夜(壹(yi)般(ban)可(ke)在PCR儀(yi)器完成(cheng))。
通(tong)常推(tui)薦(jian)16℃連(lian)接過夜(10ml體(ti)系(xi)標(biao)準連(lian)接酶(mei)量為2.5 Weiss Units即(ji)可(ke)),可(ke)以(yi)得到最多(duo)的轉化子。但(dan)是本(ben)系統含PEG Enhancer可(ke)以(yi)提(ti)高連接效(xiao)率數(shu)倍(bei),在高連接酶(mei)量的情況(kuang)下(10ml體(ti)系(xi)推(tui)薦(jian)連(lian)接酶(mei)量為5 Weiss Units)16℃連(lian)接30分(fen)鐘(zhong)即(ji)可(ke)達壹般(ban)研究(jiu)的要求。
3) 冰(bing)上冷(leng)卻(que),然後轉化或貯存於-20℃。
3. 快(kuai)速(su)連接反應:
1) 反(fan)應按(an)以(yi)下體(ti)系(xi)進(jin)行:
5ml | 2 ´ Quick Ligation Buffer (用前(qian)充(chong)分(fen)融(rong)解(jie)混(hun)勻(yun)) |
1ml | pBLUE-T Simple Vector |
Xml | 純(chun)化後的(de)PCR產(chan)物/或(huo)者1ml 1000bp control |
Yml | 無(wu)菌水(shui) |
1ml (5 Weiss Units/ml) | T4 DNA Ligase |
Final Volume | 10ml |
壹(yi)般(ban)最後加(jia)入T4 DNA Ligase。
2) 22℃連(lian)接5-10分(fen)鐘(zhong)(壹(yi)般(ban)可(ke)在PCR儀(yi)器完成(cheng))。
2 ´Quick Ligation Buffer已(yi)經包含(han)所有優(you)化的快速(su)連接成(cheng)份,通常推(tui)薦(jian)22℃連(lian)接10分(fen)鐘(zhong)(10ml體(ti)系(xi)連(lian)接酶(mei)量為5 Weiss Units,長片(pian)段(duan)連接可(ke)以(yi)延(yan)長至30分(fen)鐘(zhong))壹(yi)般(ban)可(ke)以(yi)得到滿意(yi)結果(guo)。此(ci)外本(ben)系統也可(ke)在16℃連(lian)接30分(fen)鐘(zhong)(10ml體(ti)系(xi)連(lian)接酶(mei)量為5 Weiss Units)即(ji)可(ke)達壹般(ban)研究(jiu)的要求。
3) 冰(bing)上冷(leng)卻(que),然後轉化或貯存於-20℃。
4. 轉化:
ð 50-100ml感受態(tai)細胞,置於冰(bing)上,完(wan)quan解(jie)凍(dong)後輕(qing)撣(dan)幾次(ci)將(jiang)細胞均(jun)勻(yun)懸浮。
ð 加(jia)入4-5ml連(lian)接液(最多(duo)可(ke)全部加(jia)入,只(zhi)要體(ti)積(ji)不(bu)超(chao)過(guo)感受態(tai)細胞體(ti)積(ji)的(de)1/10),輕(qing)輕(qing)混(hun)勻(yun)。冰(bing)上放(fang)置30分(fen)鐘(zhong)。42℃水(shui)浴熱激(ji)90秒。冰(bing)上放(fang)置2~3分(fen)鐘(zhong)。
ð 加(jia)500ml LB或(huo)者(zhe)SOC培(pei)養(yang)基(ji)(不含(han)抗生(sheng)素),37℃ 150 rpm振蕩培(pei)養(yang)60分(fen)鐘(zhong)。
ð 將(jiang)200ml細菌塗(tu)布(bu)在預先用16ml 50mg/ml IPTG和(he)40ml 20 mg/ml X-gal 塗(tu)布(bu)的(de)氨(an)芐qieng黴(mei)素平(ping)板(ban)上。
塗(tu)布(bu)細菌的(de)用量依連(lian)接的效(xiao)率及(ji)感受態(tai)細胞的(de)感受率而(er)進(jin)行適當(dang)的調整,如果 預計的克隆較(jiao)少,可(ke)通過(guo)離(li)心(xin)(4,000rpm,2 分(fen)鐘(zhong))後吸(xi)除(chu)部分(fen)培(pei)養(yang)液,留(liu)下適量的培(pei)養(yang)基(ji)懸浮菌體(ti)後取(qu)全(quan)部或者(zhe)適量塗布(bu)於壹個(ge)平(ping)板(ban)中(zhong)(塗布剩余(yu)的菌液可(ke)以(yi)擱在(zai)4度保存,第(di)2天如果轉化菌落數量少,可(ke)將(jiang)剩余(yu)菌液全(quan)部塗壹(yi)個(ge)新(xin)培養(yang)板(ban))。
ð 平(ping)板(ban)在(zai)37℃下正向放(fang)置1小時(shi)以(yi)吸收(shou)過(guo)多(duo)的液體(ti),然後倒置培(pei)養(yang)過(guo)夜。
5 篩(shai)選(xuan):
1). 轉化子的藍(lan)白(bai)篩(shai)選(xuan):
當(dang)外源DNA片(pian)段(duan)插(cha)入到pBLUE-T Simple 中後,由(you)於外源DNA的(de)核(he)酸序列(lie)存在(zai)改(gai)變了(le)LacZ基因(yin)的(de)編(bian)碼,從(cong)而(er)影響(xiang)了(le)其產(chan)物b-半(ban)乳糖(tang)苷酶(mei)a-片(pian)段(duan)的活(huo)性(xing),因(yin)此(ci)重組克(ke)隆在(zai)X-gal/IPTG平(ping)板(ban)上呈(cheng)現(xian)為(wei)白(bai)色,而(er)非重組克(ke)隆呈(cheng)藍(lan)色(se)。有的時(shi)候(hou)插(cha)入片(pian)段(duan)沒有(you)影響(xiang)lacZ 基(ji)因(yin)讀(du)碼框(kuang), 或(huo)插(cha)入片(pian)段(duan)太(tai)小,這(zhe)種(zhong)情況(kuang)下菌落(重組克(ke)隆)呈(cheng)現(xian)淡(dan)藍(lan)色(se)或者在(zai)菌落中心(xin)呈(cheng)現(xian)淡(dan)藍(lan)斑點,外圈白(bai)色(魚(yu)眼(yan)狀(zhuang)藍(lan)斑fish eye)。選(xuan)擇(ze)在IPTG/X-gal平(ping)板(ban)上生(sheng)長的白(bai)色菌(jun)落或者(zhe)淡(dan)藍(lan)色(se)菌落,用牙(ya)簽挑(tiao)至(zhi)含氨芐qieng黴(mei)素的(de)液體(ti)培(pei)養(yang)基(ji),37℃培養(yang)過(guo)夜。
2). 轉化子的鑒(jian)定:
a. 用上述(shu)培(pei)養(yang)的(de)白(bai)色菌(jun)落的菌(jun)液抽提(ti)質(zhi)粒,用插(cha)入片(pian)段(duan)所帶(dai)酶(mei)切(qie)位(wei)點酶(mei)切(qie),瓊(qiong)脂糖凝膠(jiao)電泳(yong)檢(jian)查片(pian)段(duan)大小,確定是否(fou)含有(you)目的片(pian)段(duan)。
b. 挑(tiao)取(qu)白(bai)色菌(jun)落直接進(jin)行PCR檢測(ce)
c. 用T3啟動子(zi)引物或M13通用測(ce)序引物測(ce)序來確定是否(fou)含有(you)目的克(ke)隆(long)。
ð 如何計算連接反應中(zhong)需要的PCR產(chan)物的(de)量?
壹(yi)般(ban)PCR產(chan)物與載(zai)體(ti)的(de)摩(mo)爾(er)比優(you)化至2:1~10:1(推(tui)薦(jian)3:1)就(jiu)可(ke)以(yi)得到良好(hao)結果(guo),可(ke)采用以(yi)下公式:
[加(jia)入載(zai)體(ti)的(de)量(ng)×插(cha)入片(pian)段(duan)大小(kb)÷載(zai)體(ti)大小(kb)]×插(cha)入片(pian)段(duan)和(he)載(zai)體(ti)的(de)摩(mo)爾(er)比=插(cha)入片(pian)段(duan)的量(ng) 例(li)如:插(cha)入片(pian)段(duan)和(he)載(zai)體(ti)連(lian)接的摩爾(er)比例(li)為(wei)3:1,如連接反應中(zhong)加(jia)入載(zai)體(ti)40ng,插(cha)入片(pian)段(duan)大小為(wei)1000bp,這(zhe)時(shi)應加(jia)入插(cha)入片(pian)段(duan)的量為[40ng載(zai)體(ti)×1kb插(cha)入片(pian)段(duan)÷2.928kb載(zai)體(ti)]×3/1=40.1ng。
Simple載(zai)體(ti)快(kuai)速(su)克隆(long)試劑盒(he) T4原(yuan)理載(zai)體(ti)